Recensement des cours sur le thème de l’environnement prévus pour l’année 2022-2023 à l’ENS (ou des cours fondamentaux conseillés pour appréhender des enjeux globaux et transdisciplinaires)
(liste non exhaustive, en cours de mise à jour : pour toute suggestion d’ajout ou de mise à jour, écrivez à l’adresse suivante : marine.fauche cefe.cnrs.fr)
Départements de Lettres
ARTS
Arts et écologie
LUNDI 17h-19H – S1 et S2 insécables, MENSUEL
En collaboration avec le CERES.
Anne-Françoise Benhamou, avec la participation de Emmanuelle Colboc (architecte) , Nadeije Laneyrie-Dagen, Isabelle Moindrot (Paris 8), Françoise Zamour
Plutôt que de s’intéresser à des œuvres dont l’écologie serait le propos déclaré ou militant, le séminaire Arts et Écologie se propose de se pencher sur des productions artistiques de la saison 22-23 (spectacles, films, exposition, architecture, littérature ..) traversées par des thèmes écologiques, environnementaux, climatiques de façons très variées, souterraines ou explicites. Il s’agira en d’autres termes d’explorer ce que la crise climatique et écologique fait aux arts. Au rythme d’une œuvre par séance, on mènera une investigation dans cet imaginaire très contemporain, mais parfois en forte relation avec des œuvres anciennes. Mesure ce qui se déplace entre passé et présent dans le champ de l’art, relativement à cette crise, fera partie de notre travail.
Informations ici : https://arts.ens.psl.eu/S2-Cours-et-seminaires-par-discipline-2021-2022.html
HISTOIRE
Histoire environnementale de l’empire français, XVIe-XXe siècles
Hélène Blais et Stéphane Van Damme
S2
6 ECTS
L’environnement a une histoire, en partie impériale. Cette histoire en plein renouvellement invite aujourd’hui à reformuler les questions liées à la formation et à la stabilisation de l’empire français sur le temps long, du XVIe au XXe siècles. Exploitation des ressources naturelles, conservationnisme, gestion des risques et catastrophes naturelles, climat, modifications agricoles et dégradations des milieux naturels, pollutions, naturalisme savant, appropriations et consommation de la nature : ces thématiques centrales de l’histoire environnementale permettront de revisiter le récit classique de la maîtrise de la nature impériale et seront abordées en croisant les exemples et en tirant profit d’un comparatisme méthodologique. Le séminaire portera sur les dynamiques socio-écologiques au cœur des mouvements de colonisation du globe par les puissances européennes. Il cherchera enfin à historiciser les thèses d’un impérialisme écologique et de la grande divergence (effondrement socio-écologiques, production des inégalités à l’échelle mondiale, etc). Quelle est la place de l’empire français dans toutes ces évolutions ? Comment réécrire cette histoire à partir de ce site d’observation ? Pour répondre à ces questions, nous nous proposons d’explorer le champ en revenant sur les débats historiographiques en cours et en présentant des dossiers de recherche.
Informations détaillées ici : https://histoire.ens.psl.eu/histoire-environnementale-de-l-empire-francais.html
SEMINAIRE MEDECINE - HUMANITES
Séminaire de recherche "One Health" : santé humaine, santé animale, santé environnementale.
Le séminaire "One Health" est organisé par Emmanuel Didier et Laurine Pasco avec Frédéric Keck.
Adresse de contact : edidier ens.fr
Adresse de contact : edidier ens.fr
Le concept récent de « One health », ou « une seule santé », désigne la coopération de la médecine humaine et de la médecine vétérinaire dans une approche centrée sur les liens entre la santé des hommes, celle des animaux et l’environnement au niveau global. Il permet de mieux comprendre des phénomènes comme les zoonoses, c’est-à-dire les transferts de pathogènes des animaux vers les humains, qui ont acquis avec les récentes pandémies de grippe et de coronavirus une importance renouvelée. Il constitue aussi un outil puissant pour comprendre comment ces interaction homme-animaux mettent en cause l’environnement tout entier, par exemple, lorsque les pollutions affectent à la fois les humains et les animaux, lorsque les restrictions des espaces vitaux des espèces sauvages les forcent à cohabiter avec les humains ou encore lorsque l’industrialisation de l’élevage et du transport d’animaux engendre de nouveaux problèmes sanitaires. Le séminaire Médecine-Humanités du premier semestre 2022 – 2023 se propose d’explorer, avec les moyens des sciences humaines, les implications et conséquences sociales très profondes engendrées par ce rapprochement entre la médecine humaine, la médecine vétérinaire et l’environnement.
S1, les mardis entre 18h et 20h
Programme détaillé et informations ici : https://www.ens.psl.eu/agenda/one-health-sante-humaine-sante-animale-sante-environnementale/2022-09-20t160000
SEMINAIRE ACTUALITE CRITIQUE
Relations Humain/Animal
Animé par Christian Lorenzi, Anne Simon et Lise Kayser
Les relations humain-animal sont au cœur de l’actualité nationale, européenne et internationale, et tout particulièrement celles qui engagent un rapport à grande échelle, non individualisé, aux bêtes. Qu’il s’agisse du bien-être animal, de l’expérimentation animale ou de la prise en compte de la souffrance animale, ou encore des zoonoses et de la crise de la biodiversité, nous sommes de plus en plus fréquemment amenés à nous questionner sur nos pratiques collectives, complexes et paradoxales.
Comme nombre de pays, la France privilégie l’élevage intensif et abat chaque année près d’un milliard d’animaux d’élevage. Une grande partie des Français considère qu’il s’agit d’un enjeu majeur. Le gouvernement actuel s’est engagé à la nomination d’un « référent bien-être animal » ayant reçu une formation obligatoire à ces enjeux au sein de chaque élevage. Faut-il aller plus loin et créer – comme certains le souhaitent – un ministère de la condition animale dédié au bien-être animal ? Comment mettre en œuvre une évolution de nos modes de consommation et de production ?
Une initiative citoyenne européenne pour l’arrêt de l’expérimentation animale soutenue par plus d’un million de signatures a récemment abouti à un vote du parlement Européen à la quasi-unanimité en faveur d’un arrêt à terme de l’expérimentation animale. Il existerait donc « des principes scientifiques solides qui invalident le modèle animal pour prédire la réponse humaine ». Comment ce débat est-il mené ? Sur quelles bases scientifiques s’appuie le Parlement européen ? Sommes-nous déjà en mesure de remplacer l’ensemble de l’expérimentation animale par des modèles in vitro et in silico ? Dans le cas contraire, quelles sont les conséquences à envisager, et sur quelles approches philosophiques et politiques fonder les décisions ?
Débats autour des causes du Covid-19, variole du singe… L’hypothèse de zoonose, à savoir la transmission d’un pathogène animal vers l’homme, alerte et inquiète. Plus avant, l’importance croissante des zoonoses – qui ont accompagné l’humain dans sa très longue histoire – relance un débat tout aussi profond qui dépasse le champ de l’épidémiologie et de la santé : y a-t-il « une bonne distance » entre l’humain et l’animal ? Ou faut-il envisager des réponses adaptées à des situations sociales et écologiques différentes, incluant des relations plurielles avec des espèces extrêmement variées.
Première séance le jeudi 22 septembre de 17h à 19h au salon de la Direction
ENS, 45 rue d’Ulm, 75005 Paris
Séances suivantes 18h-20h
Plus d’informations ici : https://animots.hypotheses.org/19389
ETUDES COGNITIVES / INSTITUT JEAN NICOT
Séminaire "Law and economics of nature, principalement organisé par Sacha Bourgeois-Gironde ( Institut Jean Nicot) et Delphine Misonne (Université Saint-Louis, Belgique).
Le séminaire Law & Economics of Nature a pour vocation de prendre acte des transformations théoriques qui, dans un contexte d’inquiétude environnementale, affectent les disciplines économiques et juridiques. Les normes juridiques qui prévalent aux régimes d’appropriation ou de gouvernance des ressources naturelles ont d’évidentes conséquences welfaristes (humaines et écologiques). Les réflexions actuelles sur le ou les communs ou encore sur la personnalisation juridique d’entités naturelles peuvent également être appréciées à cette aune. L’économie de l’environnement s’interroge de longue date sur la possibilité de fixer la valeur d’entités naturelles non marchandes. Elle oscille entre la considération des ressources environnementales comme « capital naturel » sujet à optimisation et une défense de la valeur intrinsèque de la nature non commensurable à d’autres actifs.
Le lien entre statut juridique et mesure de la valeur de la nature se tient ainsi au cœur des problématiques environnementales actuelles ; ce qui justifie une approche de type « law and economics » de la nature. Les approches juridiques et économiques doivent de plus être sous-tendues par une appréhension fine des modèles écologiques pertinents, qu’il s’agisse de valeur de la biodiversité, de justice climatique, ou de gouvernance des océans ou des rivières. Ce séminaire assume donc une démarche transdisciplinaire entre droit, économie et écologie théorique.
Plus d’informations ici :
SCIENCES DE L’ANTIQUITÉ
Histoire de l’animal dans l’Antiquité – la découverte de la faune des steppes et savanes de l’Afrique du Nord-Est
Jean Trinquier
S1 et S2, 6 ECTS PAR SEMESTRE
Le séminaire de cette année portera sur la découverte des animaux des steppes et savanes africaines par les riverains de la Méditerranée antique. C’est un chapitre particulièrement instructif de l’histoire de l’accroissement des connaissances zoologiques. Il s’agira 1) d’identifier les acteurs – explorateurs, militaires, administrateurs, ambassadeurs, voyageurs, marchands, mais aussi et surtout informateurs locaux – de cet accroissement des connaissances à la fois zoologiques et géographiques, qui s’inscrit dans la lignée des conquêtes d’Alexandre, 2) d’étudier les modalités de construction de ces nouveaux savoirs, entre biologie, climatologie et géographie, et 3) de préciser la chronologie de ce processus, de façon à comprendre pourquoi on commence à parler de telle espèce à partir de telle époque, pourquoi par exemple on « découvre » la girafe et le rhinocéros au IIIe siècle av. J.-C., mais le zèbre seulement à la toute fin du IIe siècle ap. J.-C. On étudiera les textes et les représentations figurées relatifs à ces terres lointaines et à leur faune dans une triple perspective d’histoire des savoirs, d’histoire connectée et d’histoire environnementale. La connaissance du latin et du grec n’est pas un prérequis pour ce séminaire.
Mercredi, de 14h à 16h, par quinzaine, salle Beckett
Premières séances : mercredi 28 septembre 2022 (S1) ; mercredi 18 janvier 2023 (S2)
Contact : jean.trinquier ens.fr
Géographie historique et géo-archéologie
Anca Dan
S2, 6 ECTS
Avez-vous pensé à traduire Homère ou Virgile non pas en alexandrins mais en hologrammes peuplant un espace 3D que toutes les sciences de l’Antiquité permettraient de reconstituer ? En visitant un chantier de fouilles ou un musée, avez-vous ressenti la frustration de ne pas pouvoir imaginer la vie des gens dont on conserve les traces ? Amateur de films ou jeux vidéo, vous êtes-vous demandés comment recréer l’île d’Éole ? Philologues, historiens, archéologues, géographes ou paléontologues, nous avons besoin les uns des autres pour comprendre les sites et les peuples antiques. Pour apprendre et construire ensemble cette méthodologie interdisciplinaire, nous discuterons avec nos intervenants des textes et cartes, des recherches de terrain en archéologie et géosciences (géologie, géographie et géomorphologie, géophysique, géochimie, paléobotanique et paléozoologie, anthropologie et génétique), des projets cartographiques (SIG, 3D/4D, études de visibilité, reconstitution diachronique des sites, mise en valeur de l’impact anthropique par rapport à l’évolution naturelle).
Le séminaire est ouvert à tous, sans aucune connaissance préalable.
Une journée d’études complétera la série de séances.
Site internet : http://www.archeo.ens.fr/geoarcheologie2022.html
Vendredi, 14h-17h, par quinzaine, en format hybride, sur internet (https://www.gotomeet.me/AncaDAN/geoarch) et à l’ENS, salle F, 45 rue d’Ulm
Première séance : 27 janvier 2023
Validation : assiduité et entretien à la fin de chaque semestre, pour discuter de l’apport des différentes séances à la progression de l’étudiant dans sa recherche de Master/Diplôme ENS/Thèse en cours ou à venir.
Pré-inscriptions : anca-cristina.dan ens.fr
DSA-GO-AD-S2
Appel à candidature : école thématique CNRS 2022 RADARARCHEO
du 10 au 14 octobre 2022
Le laboratoire AOROC et la MADE (Mission Archéologique du Département de l’Eure) sont heureux de vous faire part de l’organisation d’une école thématique du CNRS autour du radar-sol en archéologie.
Du 10-14 octobre 2022 GISACUM 8, rue des Thermes. 27930 Le Vieil-Evreux
Dossiers de candidature à envoyer à : radarcheo ens.psl.eu avant le 15 août minuit.
Réponse pour les inscriptions définitives : 12 septembre 2022.
Plus d’informations
SCIENCES SOCIALES
Droit international de l’économie et de l’écologie.
Florian Couveinhes Matsumoto
S2, le mardi de 16 à 18h en salle R2-02, à partir du 17 janvier
Ce cours unique en France vise à présenter et discuter l’encadrement juridique international de l’économie dans un but écologique. Cet objet invite à explorer les aspects économiques du Droit international de l’environnement et les règles à but écologique du Droit international économique strictement entendu (principalement des Droits internationaux du commerce et de l’investissement), mais également à identifier les multiples raisons - normatives, institutionnelles, juridictionnelles, systémiques, politiques et intellectuelles - du sous-encadrement juridique des opérations économiques transnationales au regard des impératifs écologiques. Enfin, il propose des solutions fondées sur des pratiques, normes ou institutions existant ou en préparation, et sur l’histoire de l’influence croissante et de la domination progressive du Droit international économique sur les autres branches du Droit international.
Il n’est pas parfaitement indispensable d’avoir suivi le cours de Droit international du premier semestre (ou de disposer de quelques connaissances en Droit international) avant de suivre le cours mais cela est très fortement recommandé. Pour les étudiants qui disposent déjà de quelques connaissances en Droit international, il est également recommandé d’avoir suivi l’atelier d’analyse de l’actualité du Droit international au premier semestre.
Plus d’informations ici : https://sciences-sociales.ens.psl.eu/Droit-international-ecologique-de
Séminaire de recherche "Natures et infrastructures : pour une anthropologie de de la ville, des techniques et de l’environnement" Thomas Cortado
S2, les mercredis de 14 à 16h
Ce séminaire a pour objectif de montrer comment le détour par les infrastructures – les réseaux de transport, le tout-à-l’égout, les centrales électriques – nous incite à repenser les rapports entre la ville, les techniques et la nature. En effet, les infrastructures ne se réduisent pas à de grosses installations physiques que pilotent des technologies particulièrement sophistiquées, elles sont composées de relations en même temps qu’elles composent des relations, à la frontière de l’homme et de la nature. Elles occupent d’ailleurs une position stratégique dans l’intensification des crises écologique et sanitaire : les infrastructures transforment en profondeur l’environnement, en répercutant l’action humaine sur de vastes échelles de temps et d’espace, et agencent les rapports entre les corps et les processus naturels.
Plus d’informations ici : https://sciences-sociales.ens.psl.eu/Natures-et-infrastructures.html
ECONOMIE
Master « Analyse et Politique Économiques » (APE)
— Environmental Economics
— Introduction to Economic History
— Development Economics (seminar)
— Environmental Policies (seminar)
— Economic policies and strategies for development in a globalized world
— From statistical physics to social sciences : an outline
— Machine learning in economics
— seminars : Development, Economic history, …
informations ici : https://www.parisschoolofeconomics.eu/fr/formation/masters/ape-analyse-et-politique-economiques/
Master « Politiques Publiques et Développement » (PPD)
— Economic policies and strategies for development in a globalized world
— STATA / R Practice Class
— Sustainable Development and Climate Change
— Economic Geography and Urban economics
— Machine Learning in economics
— Economic history
— Regulation, Environment and Markets
Plus d’informations ici : https://www.parisschoolofeconomics.eu/fr/formation/masters/ppd-politiques-publiques-et-developpement/
LITTERATURE ET LANGAGES
Eco-Dystopia, Eco-Utopia : Imagining the Future in Times of Climate Emergency
Solange Manche - S1 - Mardi - 14h00/16h00 - salle INFO 1 sauf les 11/10 et 22/11 (en salle IHMC ces deux dates-là) ; 1ère séance le 20/09/2022
Séminaire « (D)Écrire le monde »
Mandana Covindassamy, Anca Dan - S2 - 6 ECTS -Séminaire de recherche Translitterae (DSA - Littératures et Langage) - Vendredi - 14h00/17h00 par quinzaine - salle F (Archéologie - département Sciences de l’Antiquité) et sur internet (https://www.gotomeet.me/AncaDAN/geoarch) - 1ère séance le 20/01/2023 - séances suivantes : 03/02, 17/02, 17/03, 31/03, 14/04)
Comment imaginer, décrire ou expliquer le monde ? Quels transferts entre savoir scientifique et discours littéraire ? De l’Antiquité jusqu’au XIXe siècle, l’humanité a envisagé des méthodes et des modes divers, empiriques ou rationnels, pour rendre compte de l’harmonie ou du chaos du monde. Nous proposons de les explorer dans ce séminaire, avec tous ceux qui se passionnent pour l’histoire des savoirs et des littératures. L’objectif premier est de permettre à tous une familiarisation avec les différentes représentations du monde, sous des formats variés (texte oral, écrit ou inscrit, carte, globe, espace aménagé), susceptibles d’être transposés dans une création littéraire. Ces représentations seront discutées dans des perspectives transdisciplinaires et transnationales, par nos invités, littéraires et scientifiques, antiquisants, médiévistes et modernistes.
Une journée d’études transdisciplinaire (entre littérature, sciences sociales et géosciences) complètera la série des séances.
Site internet https://www.translitterae.psl.eu/seminaire-decrire-le-monde/ et http://www.archeo.ens.fr/D-Ecrire-le-monde-science-et-litterature-des-Anciens-aux-Modernes.html
Validation : assiduité et devoir écrit à la maison, sur un sujet lié à la fois au séminaire et au thème de recherche de l’étudiant, discuté au préalable avec les responsables du séminaire
PHILOSOPHIE
Regards sur les constructions de l’animal dans l’Antiquité (III) : le De Abstinentia de Porphyre
Dimitri EL MURR (Philosophie) et Jean TRINQUIER (DSA)
Dimitri EL MURR (Philosophie) et Jean TRINQUIER (DSA)
S2 –Jeudi 9h-12h – Pasteur
Calendrier spécifique : séances les 19/01/23, 26/01, 2/02, 16/02, 30/03, 13/04, 20/04
Pour la troisième année de ce séminaire (validable en tant qu’expérience transdisciplinaire dans le cadre du DENS et comme cours dans le cadre des Master PSL « Philosophie » et « Mondes Anciens »), nous poursuivrons notre réflexion sur les constructions antiques de l’animal en nous intéressant aux vifs débats suscités dans l’Antiquité par l’alimentation carnée. C’est dire que nous nous concentrerons cette année sur la question du végétarisme antique à travers la lecture systématique du traité incoutournable à ce sujet : le De abstinentia du néoplatonicien Porphyre. Comme les deux années précédentes, ce séminaire sera l’occasion, en associant nos deux départements, de croiser les approches de l’histoire de la philosophie, de l’histoire culturelle et de la philologie classique. Validation par un mini-mémoire dont les contraintes seront précisées lors de la première séance.
Architecture et nature
Mildred GALLAND-SZYMKOWIAK
S2 – Mercredi 10h30-12h30 – Résistants
La relation de l’architecture à la nature est aujourd’hui mise sur le devant de la scène, que ce soit avec la notion de biomimétisme ou du fait de la crise écologique incitant à une réflexion accrue sur les modalités du construire et de l’habiter. Il est cependant également possible d’inscrire l’étude de cette relation entre architecture et nature dans une histoire longue qui a été nourrie par la réflexion d’architectes, de théoriciens et d’historiens de l’architecture, et de philosophes. C’est en explorant ces divers types de corpus en fonction d’une démarche philosophique problématisante, et en s’interrogeant sur les différentes versions du concept de « nature » par rapport auxquelles l’architecture s’est pensée, que l’on se donnera les moyens de mettre en perspective certaines questions actuelles. Ce cours peut intéresser des étudiants de philosophie, du département des Arts et du CERES.. Validation pour DENS et Master PSL (mini-mémoire). 6 ECTS
Enquêtes, ignorance et « doutes inappropriés » – Mathias GIREL
S2 – Jeudi 14h-16h – Résistants
Le champ des études sur l’ignorance s’est maintenant solidement installé dans le paysage des sciences humaines et sociales, avec la parution cette année de la seconde édition du Routledge Handbook of Ignorance Studies. Le cours propose un parcours des principaux problèmes épistémologiques que ce courant d’études soulève. Une attention particulière sera accordée aux études récentes qui tentent de clarifier ce qu’on appelle un « doute normativement inapproprié » dans le cadre d’une controverse
Ethologie philosophique
Dominique LESTEL
S1 – Mardi 14h-16h – Assia Djebar 29 rue d’Ulm)
L’éthologie philosophique n’est pas une philosophie de l’éthologie mais un domaine philosophique qui s’intéresse à tous les agents vivants (humains ou autres-qu’humains, biologiques ou postbiologiques incluant aussi bien les fantômes, les personnages de fiction, les IA ou les avatars numériques) et aux « Mondes » qu’ils partagent - en mobilisant non seulement le point de vue de la troisième personne, mais également celui de la première personne et celui de la deuxième personne. Cette année, nous nous intéresserons à la question de savoir ce qu’est un « Monde », de Jakob von Uexküll à Second Life. Thomas Nagel estimait qu’on ne pourrait pas donner une représentation objective des états subjectifs d’une chauve-souris, mais il négligeait la possibilité de s’engager dans un « devenir chauve-souris » faisant émerger d’inquiétantes et fécondes proximités à la lisière des espèces.
SEMINAIRE D’ANTHROPOLOGIE EUROPEENNE DES RELATIONS ENTRE HUMAINS ET ANIMAUX
Frédéric Keck
Frédéric Keck
Le séminaire se tient une fois par mois le vendredi de 10h à 12h à l’ENS, au 45 rue d’Ulm, en salle de réunion du pavillon Pasteur. Il s’organise autour de la discussion par les étudiant.e.s de textes publiés récemment, parfois en présence de l’auteur.ice.
Ce séminaire vise à comprendre comment la gestion des maladies d’origine animale a reconfiguré les relations entre humains et animaux en Europe, en faisant apparaître par contraste avec d’autres régions du monde les formes d’attachement et de distance qui se construisent autour des risques d’infection et de contagion aux frontières entre les espèces. Il prend pour objet central la notion de biosécurité, qui désigne l’ensemble des mesures permettant de contrôler la circulation des pathogènes dans des lieux de concentration de matériel biologique comme des fermes, des marchés ou des laboratoires. Alors que l’Europe s’est construite comme un espace ouvert dans lequel les marchandises circulent librement, les dispositifs de biosécurité ont réintroduit des frontières entre des territoires politiques soucieux de conserver leur souveraineté, mais aussi entre différentes espèces animales perçues à travers la coupure du sauvage et du domestique.
Des réseaux de surveillance des animaux considérés comme des réservoirs de pathogènes se sont organisés au travers du continent européen, invoquant souvent le principe « Un monde, une santé » pour justifier la coordination entre des médecins, des épidémiologistes, des microbiologistes, des vétérinaires et des écologues. En s’appuyant sur des associations locales comme les chasseurs ou les naturalistes pour mieux comprendre les fonctionnements des réservoirs animaux, ils ont mis en lumière des différences, et parfois des conflits, entre des formes de relations aux animaux selon les histoires politiques et culturelles. La surveillance des animaux présente en effet des aspects ambigus voire contradictoires, puisqu’elle mélange le contrôle et le soin, et reprend des techniques de pouvoir appliquées aux populations humaines sans solliciter le consentement des animaux. Il faudra alors décrire dans quelle mesure l’attention aux signaux d’alerte portés par les animaux considérés comme des sentinelles permet de tenir ensemble des modalités variables de relation au vivant.
Première séance le 21 octobre : zoonoses et recherche en laboratoire
Départements de Sciences
BIOLOGIE
- Ecologie et Biodiversité
Niveau L3, 6 ECTS, Resp. Jean-François Le Galliard et Benoît Perez-Lamarque
Le module "Ecologie et Biodiversité" initie les étudiants aux concepts de base et aux différentes approches de l’Ecologie et de la Biologie de Evolution.
En Ecologie, l’enseignement couvre l’Ecologie des Populations, les Intéractions Multispécifiques ainsi que le Fonctionnement des Ecosystèmes, avec des sujets spécifiques sur la compétition interspécifique.
En Biologie de l’Evolution, l’enseignement couvre la Génétique des Populations et l’Inférence Phylogénétique, avec des sujets spécifiques sur l’histoire phylogénique de quelques taxa.
Les différents sujets sont précédés d’une introduction au développement historique des idées présentées.
examen écrit.
- Biologie Evolutive
Niveau L3, 6 ECTS, Resp. Henrique Teotonio
Le module "Biologie Evolutive" s’appuie sur l’enseignement homonyme du 1er semestre d’Ecologie et de Biologie de Evolution, tout en proposant des sujets plus avancés.
Cela inclue en Ecologie l’étude des réseaux trophiques et des cycles biogéochimiques.
En Biologie de l’Evolution, l’enseignement couvre la Génétique Quantitative, avec des sujets spécifiques comme la sélection de traits multiples et l’évolution moléculaire.
Les différents sujets sont précédés d’une introduction au développement historique des idées présentées.
- Ecologie expérimentale
Niveau L3, 4.5 ECTS, Resp. Jean-François Le Galliard
Discipline de plus en plus quantitative, l’écologie scientifique progresse par la confrontation de données d’observation et d’expérimentation aux prédictions de modèles mathématiques.
Au cours de ce module de pratique expérimentale, les étudiants réaliseront un mini-projet de recherche sur l’une des plateformes expérimentales du CEREEP-Ecotron Ile de France de l’ENS à Foljuif (Saint-Pierre-lès-Nemours).
Organisés en groupes placés sous la responsabilité de chercheurs et de techniciens, ils devront concevoir des protocoles, récolter des données originales et analyser les données pour répondre à une ou deux questions clairement identifiées. Thématiques abordées : méthodes quantitatives en écologie, biostatistiques, écologie végétale, écologie animale, caractérisation des écosystèmes, instrumentation scientifique.
- Idées et théories en Biologie
Niveau L3, 6 ECTS, Resp. Renaud de Rosa
Le cours se base sur la lecture d’un livre de Biologie.
Les séances consistent en une courte présentation d’une partie du livre suivie de discussion/débat. Les livres chosis peuvent être des livres d’histoire/philosophie de la biologie, des livres ayant eu une grande importance dans l’histoire de la pensée en biologie, ou des livres présentant une idée ou synthèse d’idées nouvelle. Exemples d’ouvrages traités ces dernières années : R. Lewontin - The triple Helix, S.J. Gould - Ontogeny and phylogeny, R. Dawkins - The extended phenotype, E.F. Keller - The mirage of a space between nature and nurture, D. Noble - The music of life, J. Weiner - The beak of the Finch, D.S. Milo - Good enough, D. Dennett - Darwin’s dangerous idea.
- Introduction to Ecology
Niveau L3, 0 ECTS, Resp. Régis Ferriere. Remote course for non biologists
This crash course (in English) is intended to introduce the basic notions of ecology. Around the general concept of biodiversity, students will learn the principles of population dynamics, how to define an ecological community, what an ecosystem is and examples of mechanisms that drive ecosystem function. For students who have not been exposed to ecology before, this introductory course is required to attend the ENS L3 Ecologie-Evolution 1 class. The course is scheduled in five on-line sessions.
- Introduction aux sciences du vivant
Niveau L3, 3 ECTS, Resp. Gersende Lepere. Cours pour non biologistes
Ce cours d’introduction vise à permettre à des non-biologistes de s’approprier les connaissances fondamentales nécessaires à toute compréhension des modes d’organisation, de fonctionnement et d’évolution du vivant. Il constitue un pré-requis nécessaire pour suivre la plupart des autres cours destinés aux non-biologistes et constitue la première étape de filières mixtes avec la biologie. Les généraux objectifs sont les suivants :
• permettre une compréhension en profondeur de ce qui fait l’originalité, l’unité et la diversité du vivant
• donner les informations essentielles sur la machinerie centrale, responsable des phénomènes d’hérédité, d’expression de l’information génétique et d’adaptation, et sur ses mécanismes de contrôle et leurs dérèglements éventuels
• fournir une introduction aux mécanismes-cléfs impliqués dans l’origine des espèces et de leur évolution
• illustrer par quelques exemples les méthodologies qui permettent de constituer ce savoir, et leurs limites
Thèmes abordés :
Unité du vivant : chimie du vivant, protéines et acides nucléiques, organisation cellulaire, métabolisme, membranes, signalisation et communication cellulaires, cycle cellulaire, hérédité, de l’ADN aux protéines, régulation de l’expression génique et médecine moléculaire, développement et morphogenèse.
Diversité du vivant : Individus, populations, communautés, écosystèmes : variation phénotypique et propriétés émergentes des populations. Réseaux d’interactions entre populations : structure, robustesse, évolution. Diversité des communautés et fonctionnement des écosystèmes. Evolution : marqueurs génétiques, notion d’espèce et principes de la reconstruction phylogénétique. Histoire des caractères et innovation évolutive. Evolution de la coopération et niveaux de sélection. Processus de spéciation.
Méthodes pour l’étude et la manipulation des gènes et des génomes : Méthodes de base (recombinaison in vitro, cartographie, séquençage..). Clonage moléculaire (principes, stratégies d’isolement de gènes, manipulation de gènes isolés). Organismes génétiquement modifiés (transgenèse, invalidation, mutation et remplacement de gènes, considérations éthiques)
Plus d’informations :
- Groupe de lecture "Modélisation des systèmes biologiques"(https://www.enseignement.biologie.ens.fr/spip.php?article6)
Niveau L3, 12 ECTS, Resp. Denis Thieffry, Amandine Veber et Régis Ferrière. Cours pour non biologistes
- Modélisation mathématique des systèmes biologiques
niveau L3, 6 ECTS, Resp. François Blanquart.
Les modèles mathématiques sont de plus en plus utilisés, en combinaison avec les observations expérimentales, pour décrire les propriétés complexes des systèmes biologiques et dans certains cas, les prédire.
Dans le cours de modélisation, nous explorerons différentes approches de la mécanique à la description de la dynamique et des propriétés statistiques des systèmes vivants. En combinant la résolution analytique de problèmes simples avec des exemples d’application à des systèmes biologiques, une attention particulière sera dédiée aux observations empiriques qui supportent le choix d’une formalisation mathématique.
Les étudiants acquièrent ainsi les compétences nécessaires pour :
• comprendre les travaux de biologie dans lesquels la modélisation mathématique tient une place importante
• connaître un grand nombre d’approches théoriques différentes disponibles au modélisateurs, et les hypothèses subjacentes à différents types de formalisation
• intégrer la démarche de modélisation au sein de votre propre travail de recherche en biologie
L’enseignement consiste en une majorité de cours magistraux, ou les élèves seront confrontés à une série de modèles de difficulté croissante, et participeront à la solution -analytique ou numérique- de certains d’entre eux. L’étude de simples modèles ’classiques’ sera complétée par l’analyse détaillée de publications récentes qui illustrent l’utilisation d’une démarche formelle particulière.
Deux séminaires de recherche dans lesquels des applications plus avancées seront présentés, et un séminaire historico-philosophique récapitulatif termineront le module.
- Evolution
niveau M1, 6 ECTS, Resp. Renaud de Rosa
Evolution has a unique importance in the biological sciences : it has completely reshaped the way we understand life, with consequences that extend far beyond the realm of science. Yet, despite its huge influence, evolution remains poorly understood by the public, and even among biologists. The main aim of this course is to provide a broad view of the way evolution is studied today. Dispelling the mistaken idea that evolution has no practical application is a secondary objective, to be reached along the way. The course presents recent results from various branches (including evo-devo, phylogeny, evolutionary medicine), in a large number of groups (animals mostly, but also plants, bacteria, viruses and others), over very different time scales (from billions of years to mere days). Each of those select examples will help illustrate the universality of the rules, which shaped life as we know it.
- Microbial populations
niveau M1, 6 ECTS, Resp. Eric Michel
The purpose of this module is to discover some unknown aspects of microbiology, particularly bacteriology, to show the lifestyle of microorganisms and their ability to adapt to the environment.
niveau M1, 6 ECTS, Resp. Frédéric Austerlitz
Based on the previously acquired knowledge in population genetics, the course aims at studying the factors that affect the genomic diversity of populations, and as a consequence the diversity of phenotypic traits. The fundamental concepts of evolutionary biology will also be presented.
- Evolutionary ecology
niveau M1, 6 ECTS, Resp. Jean-François Le Galliard
This course treats the evolution of behavioural, demographic and ecological traits, at the intra-specific and pairwise inter-specific levels, with an emphasis on feedbacks between ecological and evolutionary processes. With complementary empirical and theoretical approaches, we will study the effect of different types of natural selection (including kin selection and sexual selection) on the evolution of resource exploitation strategies, social behaviour (dispersal, cooperation, partner choice) and on the evolution of their plasticity. The roles of genetic determinism and of learning on the ontogenesis and evolution of animal behaviour will be discussed.
- Biology of Ecological Systems
niveau M1, 6 ECTS, Resp. Benoît Perez-Lamarque
This advanced undergraduate/graduate course addresses the topic of ecological system diversity and the underlying biological mechanisms : How do species coexist ? How are their interactions organized ? How do they shape their common ecosystem and adapt in response ? How do species interactions and environmental factors translate into patterns of diversity ? How does diversity evolve ? The purpose of the course is to provide a thorough introduction to these topics, by experts in the fields of environmental biology, community ecology, macroecology, biogeography, as well as biogeochemistry and environmental physics. Lectures will serve to review the basic concepts/models and empirical evidence and introduce cutting-edge questions, while practical sessions will consist in discussing research papers and exploring data bases. Course week 1 : Macroecology and Macroevolution. During this week, we will take a conceptual and theoretical approach to biodiversity, and address the topics of macroecologial patterns and their proximate (functional) and ultimate (evolutionary) causal mechanisms. The course will introduce the niche versus neutral theories and quantitative models for the ecology and/or evolution of interaction networks. To investigate the macroevolutionary causes of biodiversity, phylogenetic methods will be presented. Course week 2 : Ocean’s Ecology and Biodiversity
We will introduce the fundamentals of life diversity in marine environments, starting with the key notions of oceans’ physics and biogeochemistry. We will then move into the question of ocean’s biodiversity and how organisms dispere and adapt in the marine environment. A focus will be made on marine top predators and how one can study them through tracking approaches and satellite imaging. We will then explore the ‘invisible biosphere’ of marine microbes, by paying a special attention to diatoms and protists.
- Data Analysis
niveau M1, 3 ECTS, Resp. Emeline Perthame et Benoît Perez-Lamarque.
Biological data are often complex and challenging to analyze due to non-normal distributions, nonlinear relationships, spatial/temporal structures, and high dimensionality, in particular in the era of Big Data.
This course will introduce the students to key concepts and statistical tools for the experimental design and analysis of biological data. More specifically, the students will be made familiar with hypothesis testing, univariate statistical tests (e.g. ANOVA), linear models, descriptive multivariate analyses such as Principal Component Analysis (PCA) and clustering. All these different methods will be illustrated with current questions and data type in biology (e.g. “omics” data), and their associated analytical challenges will be introduced.
The course will alternate theoretical aspects and computer exercises on small datasets with the R Studio software. The students will be assigned a small project involving the different concepts and tools covered by the course.
- Introduction to Astrobiology
niveau M2, 3 ECTS, Resp. Stéphane Mazevet et Régis Ferrière
Aims : The goal of this course is to give an overview and teach the basic principles to investigate scientifically the question of life beyond Earth.
Themes : With more than 4,000 exoplanets discovered in the past 25 years, the question of finding life beyond Earth is at the forefront of modern science. In astrophysics, this translates in a massive effort to develop a new generation of ground and space telescopes that will bring groundbreaking observations in the coming decade. These observations are not direct ; they focus, in the most favorable cases, on the spectroscopic characterization of the atmosphere. In this context, detecting biological activity beyond Earth translates into identifying the influence of the biosphere on the atmosphere and quantifying biotic and abiotic processes governing its long term evolution.
Organisation : This will be achieved though a novel integration of ecology and planetary science. The course will introduce the students to the knowledge and techniques needed to contribute to this interdisciplinary research field. The course will cover the revised history of the Earth and the solar system and its robotic exploration ; the detection and characterization of exoplanets ; the long term evolution of Earth, Mars, and Venus ; the notion of habitability extended to extraterrestrial environments.
- Changing Climate, Changing Behaviors
niveau M2, 3 ECTS, Resp. Roberto Casati, Jean-Pierre Nadal
Climate change prevention and mitigation requires behavioral change or reconfiguration of behaviors and policies. Aims : The goal of this class is to establish a transformational contact between expertise in geoscience and biological sciences and expertise in behavioral and cognitive sciences on environmental issues.
Themes : The course, 1. Draws from the life sciences and geosciences to understand what has an impact on climate change (i.e., the causal chains) ; 2. Draws from economics to understand how to regulate and incentivize citizens and firms to go towards what has a positive impact ; 3. Draws from the cognitive science to understand the psychological and social side of the needed change (how to understand and change individuals’ and groups’ behavior). Organisation : The class will meet weekly over the Fall semester. Multiple guest lecturers will be featured.
- Terrestrial Ecosystems and Global Change : Theory and Experimentation
niveau M2, 3 ECTS, Resp. Samuel Abiven
Aims & Themes : Natural and anthropized terrestrial ecosystems are strongly affected by global change drivers like nitrogen deposition, biodiversity loss or land use change. These drivers modify biochemical cycles, at small to global scales. To better understand and predict these changes, it is possible to experiment and model the interactions between these drivers feedbacks and the soil-plant systems. We propose to work during a full week on these questions linking terrestrial ecosystems and global changes. We will combine lectures and practical works. After a reminder about terrestrial biosphere functioning, we will focus on a series of global changes : nitrogen deposition, water mass balance and related events like drought, temperature increase, atmospheric CO2 concentration increase, natural fires, plant biodiversity decrease, among others. Part of these theoretical classes will be presenting the technical approaches we will be using in the practical part, as well as the modeling of these global changes on biogeochemical cycles. In the same time, we will lead a series of experiments on small ecosystems (plant + soil), which were grown under some of these global change drivers. We will particularly study the carbon cycle (isotopic labelling experiment, mass balance calculation, soil respiration), the water cycle, (time series data analysis, mass balance), nutrient cycles (mineral nitrogen), biodiversity dynamics, soil properties (aggregates stability, chemical and biological quality of soils). Organisation : This module will take place during one week in November at the CEREEP-Ecotron Ile de France, at Saint-Pierre-les-Nemours. The students will be able to stay at the station for the week and all the lectures and experimental work will take place on site. Cost of transportation and lodging will be covered by PSL Graduate Program Earth and Biodiversity – Science with Society.
- Adaptive Dynamics modeling
niveau M2, 3 ECTS, Resp. Régis Ferrière
Adaptive dynamics modeling has become the dominant theoretical framework for ‘Darwinian ecology’, i.e. the investigation of the ecological causes and consequences of evolution.
Aims : The course will present the key concepts underlying the adaptive dynamics approach : environmental feedback loop, invasion fitness, evolutionary singularity, evolutionary stability, evolutionary branching, evolutionary suicide, pairwise invasibility plots and canonical equations. The general framework will be applied to study the eco-evolutionary dynamics of populations competing for resources, predator-prey interactions, and mutualistic systems. Hands-on tutorial sessions will aim at simulations of specific examples.
Course format : This is a one-week intensive course. Lecture-style presentations will be complemented by computer-based tutorials.
In the tutorial sessions, students will work to implement the theory and study model examples numerically. This will involve the guided writing of simple code in Python.
- Quantitative Viral Dynamics
niveau M2, 3 ECTS, Resp. François Blanquart
Aims & Themes : The course presents a theoretical foundation from which to model and predict the ecological and evolutionary dynamics that result from the interaction between viruses and their hosts, both microbial and human. The course will present foundational principles and applications of viral ecology and evolution in bacteria populations, epidemiological dynamics of endemic and emerging viruses in human populations, and the models used to understand and control viral dynamics. Finally, the course will present how genomic data can give insights into the origins, epidemiological dynamics and spatial spread of pathogens. In doing so, students will learn more about how to link mechanisms of virus-host interactions across scales from cells to populations. Organisation : This is a one-week intensive course. Lecture-style presentations will be complemented by computer-based tutorials. In the tutorial sessions, students will work to implement the theory and numerically study model examples. This will involve the guided writing of simple code in Python.
This is a one-week intensive course. Lecture-style presentations will be complemented by computer-based tutorials. In the tutorial sessions, students will work to implement the theory via the numerically study of model examples. Tutorials will involve the guided development of simulations and analysis in Python and/or R. The course is targeted to interdisciplinary audiences, including students with background in the life sciences, physics, mathematics, engineering, and/or computing.
- Advanced Data analysis
niveau M2, 3 ECTS, Resp. Clément Léna, Amaury, Lambert.
Themes : La biologie moderne fait un usage intense de diverses techniques d’analyse de données destinées à quantifier, comparer, trier, étudier l’évolution dans le temps ou l’espace, etc.
Objectifs : L’objectif de ce module est de présenter un ensemble d’approches utilisées dans de nombreux champs de la biologie et de s’initier à leur mise en œuvre par des outils logiciels standards (librairies python et R) afin de pouvoir être rapidement capable de traiter de ses données (par exemple en stage).
Organisation : Ce nouveau module combinera des cours d’introduction méthodologique, des présentations de mise en œuvre scientifique, des travaux dirigés en salle informatique et des projets personnels.
- Individual student project in modeling and data anlysis
niveau M2, 3 ECTS, Resp. Olivier Tenaillon, Sarah Samadi
Aims : To harness student’s education during EvoGEM to model and/or analyze relevant data addressing a problem which will be assigned to each student. Themes : Any problem in evolutionary genetics that will be covered during EvoGEM courses, these can include : origin of sequence and trait variation, natural selection and adaptation, genetic drift and maintenance of diversity, phenotypic evolution, developmental evolution, evolution of sex and recombination, speciation and macroevolution. Organisation : The organizer will introduce in the first day available projects to the students and will assign a tutor to each one. During the semester students will independently work on the project, with mandatory meetings with their tutor in weeks 42 and 47.
- Mathematical models and tools for evolutionary genetics
niveau M2, 3 ECTS, Resp. Amaury Lambert, Christine Dillmann
Aims : To introduce students to the basic mathematical methods and tools to analyze classical models of evolutionary genetics, with special emphasis on population genetics modeling.
Themes : We will introduce students to differential non-linear equations and characterization of equilibrium dynamics, positive matrices and the Perron-Frobenius theorem, the Central Limit theorem, Markov chains in discrete and continuous time, transition matrices, Poisson processes, diffusion and infinitesimal generators, algorithms for simulation, sampling and Bayes inference. We will discuss the concepts of likelihood and introduce tools such as MCMC, Gibbs sampling and ABC.
Organisation : The course will have 3h of lectures in the mornings only.
- Genomes, Populations, Species
niveau M2, 3 ECTS, Resp. Guillaume Achaz
Aims : This course will address the fundamental processes that are at work in evolution through the lens of molecular evolution and population genetics. It will devote time to statistical inferences based on the patterns of polymorphisms in sequence data. The intended participants are students motivated by the understanding of evolutionary processes and not entirely reluctant to theoretical models.
Themes : The course will cover many of the classical micro-evolutionary processes such as genetic drift, mutation, recombination, population subdivision, isolation/speciation and natural selection. Mostly, we will discuss how these processes can be modelled backward in the so-called coalescent framework and how the distributions of genealogical trees under various scenarios lead to di-erent patterns in the polymorphisms. Emphasis will be on the relationships between the "theoretical" models and the observed "biological" data. Practical sessions of data analysis
and seminars of researchers on a variety of organisms will illustrate the lectures.
Organization : The course lasts one full week, with a lecture in the morning and a mix of research seminars and practical sessions on computers in the
afternoon.
- Advanced mathematical modeling
niveau M2, 3 ECTS, Resp. Amaury Lambert, S. Robin
Aims : To introduce students to the application of mathematical methods and tools in evolutionary genetics.
Themes : We will discuss population genetic dynamics as applied to calculate the probability and time for fixation/extinction and stationary distributions. We will detail the coalescent and characterization of genetic diversity at one and multiple loci with recombination and selection. We will also discuss the coalescent in the context of birth-death models in phylogenetics and random trees. Finally, we will give an overview of quantitative genetics modeling, such as heritability, GWAS and Fisher’s geometric model.
Organisation : The course will have 15h of lectures, each followed by 1.5h practicals (TD).
- Quantitative Evolutionary Genetics
niveau M2, 6 ECTS, Henrique Teotónio, Pierre de Villemereuil, Alain Charcosset
Aims : This is an advanced graduate course in quantitative genetics as applied to understand the evolution of complex traits, those traits whose expression is conditional on environment and on many genes. The students will learn how to partition and estimate the several components of phenotypic and genetic (co)variation, as well as define and estimate (multivariate) selection gradients. We will discuss the Robertson-Price identity and Fisher’s fundamental theory of natural selection.
Specific topics will include understanding natural selection and genetic drift in experimental and natural populations, evolution of phenotypic plasticity and robustness, inbreeding and outbreeding depression, genomic prediction of complex trait values (including humans) and genomic selection, among others.
Organisation : In the mornings lectures and seminars will be given by the coordinators and invited faculty, in the afternoons there will be computer projects on data analysis and numerical simulations of complex trait evolution.
CHIMIE
2ème année du DENS (Master de Chimie de Paris Centre)
— Physico-Chimie du Vivant (Ludovic Jullien, S1) https://www.chimie.ens.fr/formation/dens/2a/physico-chimie-du-vivant/
- Bio-inorganic chemistry (Clotilde Policar, S1) https://www.chimie.ens.fr/formation/dens/2a/bio-inorganic-chemistry/
SEMINAIRES DE L’EHESS
Philosophies de l’océan : les droits de l’océan
Histoire, Philosophie et épistémologie, Psychologie et sciences cognitives, Sociologie
organisé par Roberto Casati
S2
les jeudis de 16 à 18H à partir du 9 mars
Descriptif :
Le séminaire poursuit les recherches sur les représentations des espaces maritimes menées en 2021-2022. En 2022-2023, nous nous concentrerons sur les « droits de la mer », en étudiant certaines représentations codifiées dans des lois formelles et informelles, ou faisant l’objet de discussions publiques. Les représentations et les tensions entre les représentations se cristallisent dans le droit, entre les ambitions territoriales et les intérêts souvent en conflit (travailleurs de la mer, États-nations, entreprises, activistes, mais aussi êtres vivants marins et terrestres).
Il ne s’agira pas d’un séminaire de philosophie de droit, mais d’un double parcours allant du droit aux représentations de l’environnemement, et des représentations au droit. Le séminaire s’articule (sans le présupposer), avec le cours Climate Change Changing Behaviors (au S1). Le changements massifs de comportement souhiatés pour faire face à la crise environnementale sont à costruire dans le cadre de nouvelles lois. La philosophie peut-elle accompagner le parcours vers des normes plus adéquate à la crise ?
Informations complètes et programme ici
